1993年4月，郑宗凯退休，陈昌良接任内江铁路机械学校校长。陈昌良是由本校教师成长起来的校领导。学校基建放缓，致力于内涵建设。

1994年8月，内江铁路机械学校被国家教育委员会确定为国家级重点中专。学校办学水平稳居全省前列，进入全国一流。

学校定制的纪念手表。

成都铁路局局长王源峰为学校题词。

学校在全国最早开办内燃机车、电力机车和铁道供电专业，长期致力于专业建设。20世纪八九十年代，全国铁路开始大规模电气化改造。蒸汽机车于九十年代彻底退出运营，电力机车于21世纪初成为全国铁路运输的主力，内燃机车仅用于个别支线、调车、救援等。学校内燃机车专业于1987年停办。

学校1975年开始设立专业科，促进了专业建设。后来专业科经过了撤销、重设、再撤销的过程。新校区成立后，改为设立教学系。

1998年11月，电力机车、铁道供电、铁道信号、综合电信四个专业通过铁道部组织的专业评估，1999年被铁道部评为优秀专业点。综合电信就是当年的铁道通信。四个骨干专业经过二十多年的建设，修成正果。四个专业的技术含量都很高，学校在全国都处于一流水平。

电力机车专业是学校的龙头专业，2003年还成为四川省重点专业点，2017年被教育部、交通运输部等五部委评为“交通运输类示范专业”（这个专业示范点全国只有七个）。2012年12月，铁路机车司机培训考试中心公布铁路机车司机培训基地名单，学校铁路机车司机培训基地通过复评，在全国16个电力机车司机培训基地中排名第6。

这是2006年电力机车专业举办的轨道车司机订单班。

学校除了四个铁路重点专业外，还在探索建设非铁路专业。1992年，学校开设了电子计算机及运用、企业供电、无线电技术三个非铁路专业，按委培计划招生和分配。九十年代末期，学校先后增设了机电技术应用、自动控制技术、制冷与空调、机电工程、信息工程、信息技术等新专业，在企业供电、计算机及应用等专业进行“宽基础、活模块”教改，实行多证书制度。大部分非铁路专业效果不彰，进入21世纪后逐步淘汰。其中，学校在计算机专业和数控技术专业上投入较多，取得了一些成效。

1999年10月，学校建成校园计算机网络。2001年在互联网上建成网站“内江铁路机械学校”www.ntjx.org。2004年被教育部和信息产业部确定为“计算机应用和软件技术专业技能型紧缺人才培养培训基地”。2011年1月，学校被列入首批国家中职示范校建设计划，计算机专业实训基地建设便是重点。学校利用计算机软件开发和电力机车模拟驾驶系统建设上的技术优势组建了铁晟科技开发公司，利用数控技术专业建设上的技术优势组建了赛顿加工厂，探索教学实训与生产相结合。

学校在信息技术方面的成就与二十多年的持续投入密不可分。

这是2005年的计算机机房。

传统的中专教学属于学科型教学体系，强调各个学科自成体系，更在乎学生的学历水平。随着中国工业化的快速发展，对技能型人才的需求越来越高，传统的学科型教学模式越来越不适应。

1995年9月，成都铁路局开始借鉴德国职业教育双元制教学模式，在职业教育中推行CBE教学改革试点，实施以能力为本位的教学改革，加大实践教学力度，重视学生实际操作能力的培养。内江铁路机械学校当然不甘落后，率先成为试点学校。观念的转变需要一个较长的过程，一旦转变了就将获得新的发展方向和动力。

学校编制了电力机车、铁道信号两个专业的职业能力表，开始在两个专业进行CBE教改试点，逐步形成了一套与理论教学相互平行相对独立的实践教学体系。这两个专业的教改经验分别获得成都铁路局教改成果一、二等奖，电力机车专业的CBE教改方案获教育部中等职业学校教育教学成果三等奖。1998年，学校CBE教学改革荣获铁路中专首届优秀教育教学成果三等奖。随后CBE教学模式推广到综合电信和铁道供电专业。这场教改推动全校教师转变了教学观念，对实践教学的重要性有了充分的重视。进入21世纪后，学校又推动了“理实一体”教学模式改革，进一步强化实践教学。

1996年，学校成立“国家职业技能鉴定所”和“铁路特有工种职业技能鉴定站”，逐步开展机车电工、机车钳工、变电所值班员、接触网工、信号工、通信工等工种的技能鉴定工作。鉴定工种逐渐增多，在新校区增加了铁路线路工、客运员、货运员等鉴定工种，共有20多个工种。学生考证后可以在铁路企业直接持证上岗，所以学生积极性较高。这对加强实践教学具有推动作用。进入21世纪后，实践教学与理论教学的比例基本达到1：1。

九十年代，学校基本上每年召开一次教育教学研讨会，交流学术论文；每年编印一期《内江铁路机械学校学报》，在校内交流。

1972年至2001年，学校的铁路专业根据铁道部招生分配计划实行统一招生、统一分配，初中生学制四年，高中生学制两年。这种学生又称定向生，整体素质很高，中考成绩最优秀的那部分和高考成绩良好的人才能被录取。生源以川、渝、滇、黔为主，遍布全国绝大多数省市。

学校不刻意追求社会上的知名度，但在铁路行业内早已闻名遐迩，在内江市名震一方。